Sistem Penjaminan Mutu Internal (SPMI) di Program Studi Matematika Universitas Ahmad Dahlan (UAD) berada di bawah koordinasi Badan Penjaminan Mutu (BPM). Dalam pelaksanaannya, BPM bekerja sama dengan Pengendali Sistem Mutu Fakultas (PSMF) di tingkat fakultas serta Pengendali Sistem Mutu Prodi (PSMP) di tingkat program studi. BPM memiliki tanggung jawab penuh dalam menjalankan SPMI di UAD, mulai dari penyusunan dokumen mutu hingga pelaksanaan Audit Mutu Internal (AMI).

Pelaksanaan audit oleh BPM dilakukan sesuai jadwal yang telah ditetapkan dan bertujuan untuk memastikan keberlanjutan peningkatan mutu pendidikan. Sistem manajemen mutu dalam SPMI diterapkan melalui siklus Penetapan, Pelaksanaan, Evaluasi, Pengendalian, dan Peningkatan (PPEPP). Evaluasi yang dilakukan bertujuan untuk mengidentifikasi indikator kinerja yang belum memenuhi standar agar dapat disusun langkah-langkah perbaikan yang tepat.

Selain itu, hasil evaluasi terhadap kepuasan sivitas akademika terhadap standar yang diterapkan digunakan sebagai bahan analisis untuk memberikan rekomendasi peningkatan mutu. Dengan demikian, upaya pemenuhan standar mutu di Program Studi Matematika UAD dapat terus disesuaikan dengan kebutuhan akademik dan perkembangan kebijakan pendidikan tinggi.